• Prace przy zagrożonych gniazdach są prowadzone przez firmy specjalistyczne oraz Rejony Energetyczne. Obejmują one następujące zadania:
  Podnoszenie na specjalne platformy metalowe, gniazd posadowionych na czynnych słupach energetycznych;
• Cięcie pędów zasłaniających dolot do gniazd umieszczonych na drzewach;
• Stawianie wolnostojących słupów z platformami gniazdowymi w sytuacji, gdy planowana jest rozbiórka budynku, na którym znajduje się gniazdo, gdy suche drzewo z gniazdem grozi złamaniem czy wywróceniem lub, gdy gniazdo stwarza sytuacje konfliktowe (np. znajduje się na czynnym kominie budynku mieszkalnego) i należy je przenieść itp.)
• Montowanie platform pod gniazda, które grożą osunięciem na budynkach i drzewach.

Głównymi elementami programu są:

• ochrona zagrożonych gniazd bocianich;
• ochrona terenów żerowiskowych; 
• ratowanie osobników kontuzjowanych; 
• edukacja; 
• gromadzenie danych naukowych

Ochrona terenów żerowiskowych

Aby utrzymać tereny żerowiskowe bociana, a także środowiska życia innych o wiele rzadszych gatunków roślin i zwierząt prowadzi się praktyczne działania sprzyjające utrzymaniu ekstensywnego rolnictwa. Polegają one m.in. na promocji programów rolno-środowiskowych będących instrumentem wspomagającym utrzymanie dotychczasowych metod gospodarowania. Stosowane są także zachęty finansowe dla rolników mające doprowadzić do utrzymania hodowli zwierząt oraz przywrócenia wypasu i koszenia. Na najcenniejszych terenach (obszar Parku Krajobrazowego Podlaski Przełom Bugu) organizowane są akcje usuwania sukcesji roślinnej (dotychczas odkrzaczono w ramach akcji ponad 60 ha łąk i pastwisk). Zabiegi te pozwalają zachować siedliska dla niektórych rzadkich gatunków roślin i zwierząt oraz wpływają na utrzymanie lokalnej populacji bociana białego na dotychczasowym poziomie. Aby w kolejnych latach niektóre najcenniejsze siedliska będące jednocześnie żerowiskami bociana białego nie uległy degradacji, zaplanowano ich wykup. Pozwoli to prowadzić racjonalną gospodarkę podporządkowaną ochronie przyrody

Edukacja

Bocian biały jest idealnym obiektem do prowadzenia edukacji ekologicznej. Dzięki powszechnej sympatii, jaką jest darzony, udaje się prowadzić ogólnopolski program jego ochrony, szeroki program edukacyjny itp. Dzięki temu ptakowi można w prosty sposób przybliżać problemy ochrony terenów podmokłych będących środowiskiem życia wielu rzadkich i zagrożonych gatunków, dla których bocian stał się gatunkiem tarczowym. W programie ochrony bociana białego realizowanym przez Towarzystwo równolegle prowadzi się działania edukacyjne na kilku poziomach. Edukacja polega m.in. na organizowaniu i prowadzeniu prelekcji przyrodniczych dla dzieci, młodzieży oraz dorosłych. Ważnym elementem tego zagadnienia jest organizowany od kilku lat rajd rowerowy "Szlakiem bocianich gniazd", w którym uczestniczy każdego roku kilkadziesiąt osób z kilku szkół podstawowych, gimnazjów oraz grupa osób dorosłych. W trakcie rajdu przybliża się zagadnienia związane z programem ochrony gatunku, rolą dolin rzecznych będących najcenniejszymi żerowiskami, ochroną gatunków krajobrazu rolniczego czy problematyką ratowania ptaków kontuzjowanych. W ramach programu prowadzi się także edukację dorosłych. Polega ona m.in. na organizacji szkoleń dla lekarzy weterynarii pt "Jak pomagać poszkodowanym ptakom", szkoleń dla osób biorących udział w liczeniach bocianów na powierzchniach próbnych, szkoleń dla służb energetycznych itp. Od roku 2002 Towarzystwo realizuje projekt polegający na przekazywaniu najlepszych polskich doświadczeń w ochronie bociana białego służbom energetycznym, przyrodnikom oraz dzieciom i młodzieży z Ukrainy.